石峁遗址管理处内设六个科室：
（一）办公室
主要职责是：综合协调各部门工作，督促管理处各项制度的落实，督办管理处重点工作。负责管理处党建工作。负责行政事务的处理工作，负责后勤保障工作。
（二）规划建设科
主要职责：负责编制石峁遗址相关规划工作。按照遗址规划，结合实际，科学合理安排实施各类项目。负责管理处文物保护工程和其他技术设备项目的招标和实施工作。负责审批遗址保护范围和建控地带的建设活动。负责对接各级政府、国土和安监等部门，保障管理处依法行使职权，实现对遗址的有效保护。
（三）宣传教育科
主要职责：负责管理处的宣传与教育工作。负责管理处基本陈列和各类展览工作。负责联系旅行社、宾馆及文化相关网站，进行展览推广及宣传，提升石峁遗址的知名度和社会影响力。负责管理处文化旅游产品的开发和经营工作。负责对接各级政府宣传部门和媒体，做好石峁遗址的公关工作。
（四）文物保护科
主要职责：全面负责管理石峁遗址范围内的文物保护工作。监督管理石峁遗址的保护范围和建设控制地带内的工程建设。负责石峁遗址的文物调查、征集和陈列展示工作。按照有关文保单位的安全管理规定，建立完善“人防、技防、物防”三位一体的安全防范体系，建立健全石峁遗址安全管理的各项制度，做好安防、消防等设施的管理、操作与维护。
负责遗址范围内所有标识、标牌等有关展示设施、设备保养与维修工作。在遗址保护范围内进行定期巡查，杜绝破坏遗址整体风貌、遗址本体和出土文物的现象。
（五）文化研究室
主要职责：负责征集、整理、汇总石峁遗址相关资料。
负责管理图书、档案等资料，并进行分类编目存储管理，为全处业务工作与学术研究提供资料和信息。负责编制管理处的内部期刊和工作简报。负责整理汇集有关石峁遗址的专著和论文，对接考古专家和科研院校，确保管理处掌握石峁遗址的最新学术信息。
（六）公共事务科
主要职责：负责各类公务接待和学术考察活动。负责管理遗址范围内的卫生和绿化等工作。负责确保遗址范围内的道路畅通工作。
办公电话：0912-8615239
